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Im Allgeneinen sollte es mögliuch sein alle noch sichtbaren Tabellen in eine neue Datenbank zu überführen (weil die unsichtbare Tabelle nicht übertragen wird, würde suie dadurch indirekt gelöscht) und dann mit dieser neuen Datenbank weiterzuarbeiten.

Falls es sich im Speziellen um eine eingebettete HSQL-Datenbank handelt, käme wohl auch dieser Weg infrage:
viewtopic.php?p=271131#p271131

Zitat:
"Die Daten der Datenbank liegen in der *.odb-Datei im Unterverzeichnis «database». Hier gibt es eine Datei «data» und eine Datei «backup». Ist die Datei «data» defekt, so kann sie über die Datei «backup» wiederhergestellt werden. Hierzu muss die im Verzeichnis «database» liegende Datei
«properties» bearbeitet werden. Hier gibt es eine Zeile «modified=no». Diese muss umgeschrieben werden zu «modified=yes». Das zeigt dem System an, dass die Datenbank nicht korrekt beendet wurde. Jetzt wird aus der komprimierten «backup»-Datei beim Neustart eine neue «data»-Datei erstellt. "


Gruß
Stephan

Vielleicht auch einfach etwas an der falschen Stelle versucht:
Extras → Tabellenfilter
Einfach überprüfbar durch eine Abfrage
SELECT * FROM "Tabellenname"

Konntest du deine verschwundene Tabelle inzwischen schon wieder auftreiben?
Wenn ja, wie genau hast du festgestellt, das deine Tabelle fehlt, bzw. welche waren deine Arbeitsschritte zuvor?
Ich hatte bereits ein ähnliches Problem und genau mit dem Arbeitsschritt, den *RobertG* beschrieben hat, SELECT FROM "Tabellenname" ist sie wieder aufgetaucht. Ich weiß allerdings auch nicht, was die Ursache des Problems war.